L’observation microscopique est à la base de nombreux programmes de recherche du laboratoire. Un parc d’une vingtaine de microscopes et loupes binoculaires est disponible. Il permet, entre autres, de réaliser des observations microscopiques en lumière transmise et réfléchie, d’analyser la déformation des roches mais aussi de réaliser l’analyse microthermométrique des inclusions fluides. Certains de ces appareils sont munis de caméras et appareils photo (numérique et argentique) permettant la capture d’images numériques.